ФилеЗилла Сервер – моћан ФТП сервер са напредним скупом функција. Софтвер се састоји од сервера који ради као системска услуга и апликација уз подршку даљинског приступа који управља овим сервером. ФилеЗилла Сервер подржава РТП, СФТП и ФТПС протоколе и пружа поуздан ниво заштите података због ССЛ енкрипције. ФилеЗилла Сервер вам дозвољава ограничење приступа корисника серверу, блокирање преузимања са сервера или интерних ИП адреса, прилагођавање односа компресије пренесених датотека, ограничавање максималне брзине преноса итд. ФилеЗилла Сервер прикупља статистике активности на ФТП-у-вервер у реалном времену који омогућава откривање корисника који тренутно преузима датотеке или се баве незаконитим радњама.